Współpraca w regionie należy do strategicznych obszarów rozwojowych statystyki publicznej. Działania realizowane w zakresie rozwoju statystyk i analiz, niezbędne dla podejmowania właściwych decyzji rozwojowych i inicjatyw w regionach, mają na celu zapewnienie odbiorcom wysokiej jakości produktów statystycznych, specjalistycznej obsługi informacyjnej i analitycznej.
Zapewnienie profesjonalnej, rzetelnej i obiektywnej informacji statystycznej, odzwierciedlającej sytuację społeczno-gospodarczą regionu, dostosowanej do potrzeb odbiorców, jest głównym zadaniem działających w urzędach statystycznych Wojewódzkich Ośrodków Badań Regionalnych.
W ramach swej działalności Urząd Statystyczny w Krakowie współpracuje z:
Uczelniami i szkołami wyższymi:
- Uniwersytetem Jagiellońskim w Krakowie;
 - Uniwersytetem Ekonomicznym w Krakowie;
 - Akademią Górniczo-Hutniczą im. St. Staszica w Krakowie;
 - Uniwersytetem Rolniczym im. H. Kołłątaja w Krakowie;
 - Politechniką Krakowską im. T. Kościuszki;
 - Uniwersytetem Pedagogicznym im. Komisji Edukacji Narodowej w Krakowie;
 - Krakowską Akademią im. A. Frycza Modrzewskiego;
 - Uniwersytetem Ekonomicznym w Poznaniu;
 - Państwową Szkołą Wyższą w Tarnowie;
 - Państwową Szkołą Wyższą w Nowym Sączu.
 
Jednostkami administracji rządowej i samorządowej:
- Małopolskim Urzędem Wojewódzkim;
 - Małopolskim Kuratorem Oświaty;
 - Narodowym Bankiem Polskim oddział w Krakowie;
 - Izbą Administracji Skarbowej w Krakowie;
 - Urzędem Celno – Skarbowym w Krakowie;
 - Urzędem Marszałkowskim Województwa Małopolskiego;
 - Wojewódzkim Urzędem Pracy w Krakowie;
 - Grodzkim Urzędem Pracy w Krakowie;
 - Urzędem Miasta Krakowa;
 - Urzędem Miasta Tarnowa;
 - Urzędem Miasta Nowego Sącza.
 
Pozostałymi partnerami:
- jednostkami samorządu terytorialnego;
 - środowiskami naukowymi;
 - organizacjami non profit;
 - jednostkami otoczenia biznesu;
 - szkołami;
 - mediami;
 - innymi instytucjami.